Theo Cơ quan Khí tượng Nhật Bản, các đợt sóng thần đầu tiên đã được ghi nhận dọc theo bờ biển phía tây nam nước này vào khoảng 17h55 ngày 8/6 (giờ địa phương), chỉ vài giờ sau khi trận động đất mạnh 7,8 độ richter xảy ra ở vùng biển ngoài khơi Mindanao, Philippines.
Các nhà chức trách Nhật Bản đã phát lệnh sơ tán khẩn cấp cho người dân sống ở các khu vực ven biển thuộc tỉnh Kochi, Miyazaki và Kagoshima, đồng thời khuyến cáo người dân tránh xa bờ biển cho đến khi có thông báo mới. Cảnh báo sóng thần cũng được đưa ra cho nhiều tỉnh khác trên khắp quần đảo Nhật Bản.
Trận động đất ban đầu được Trung tâm Cảnh báo Sóng thần Thái Bình Dương đánh giá có khả năng gây ra sóng thần nguy hiểm trong phạm vi 1.000 km tính từ tâm chấn. Các chuyên gia cho biết sóng thần cao từ 1 đến 3 mét có thể ập vào các bờ biển Nhật Bản trong vòng vài giờ tới.
Thủ tướng Nhật Bản đã chỉ đạo thành lập ngay tổ công tác đặc biệt để phối hợp công tác cứu hộ, đồng thời yêu cầu các bộ ngành liên quan theo dõi chặt chẽ tình hình và cập nhật thông tin liên tục cho người dân. Đến nay chưa có báo cáo thương vong hay thiệt hại nghiêm trọng, nhưng giới chức cảnh báo các đợt sóng thần tiếp theo có thể còn mạnh hơn.
