Hàng trăm người Kenya đã xuống đường biểu tình tại thị trấn Nanyuki trong hai ngày thứ Hai và thứ Ba, phản đối trung tâm cách ly Ebola do Mỹ xây dựng tại căn cứ không quân Laikipia, nơi tiếp giáp với căn cứ quân sự của Kenya. Các cuộc biểu tình đã trở nên bạo lực vào thứ Hai, khiến ít nhất hai người thiệt mạng và một người bị thương.
Giới chức Mỹ trước đó xác nhận với báo chí rằng cơ sở này sẽ tiếp nhận những công dân Mỹ nhiễm virus Ebola khi ở nước ngoài, thay vì cho phép họ hồi hương. Kế hoạch này vấp phải sự phản đối mạnh mẽ từ người dân Kenya cũng như nghiệp đoàn nhân viên y tế nước này.
Kenya chưa từng ghi nhận ca mắc Ebola nào và hiện không có ca bệnh được xác nhận. Tuy nhiên, người dân lo ngại việc đưa bệnh nhân từ nước ngoài về sẽ dẫn đến nguy cơ lây lan dịch bệnh. Công đoàn Y sĩ, Dược sĩ và Nha sĩ Kenya tuyên bố sẽ không để Kenya bị coi là 'thuộc địa cách ly', khẳng định 'nếu quá nguy hiểm cho Mỹ thì cũng quá nguy hiểm cho Kenya'.
Hiện tại, Tổ chức Y tế Thế giới (WHO) đã ban bố tình trạng khẩn cấp y tế công cộng quốc tế vào ngày 17/5 sau khi phát hiện chủng virus Bundibugyo hiếm gặp đã lưu hành nhiều tuần tại CHDC Congo. Khác với chủng Zaire phổ biến, chủng Bundibugyo hiện chưa có vắc xin hoặc phương pháp điều trị nào được phê duyệt. Virus đã lây lan sang Uganda láng giềng, với 321 ca nhiễm và 48 ca tử vong tại CHDC Congo, cùng một ca tử vong và 9 ca nhiễm tại Uganda.
Chính phủ Kenya giữ lập trường bảo vệ dự án. Tổng thống William Ruto cho biết ông đã đồng ý với yêu cầu từ Tổng thống Mỹ Donald Trump khi cho rằng đây là thỏa thuận hợp tác với những người bạn đã đồng hành cùng Kenya nhiều thập kỷ. Tuy nhiên, một tòa án tại Nairobi đã ra lệnh tạm đình chỉ việc xây dựng và tiếp nhận bệnh nhân trong ít nhất ba tuần, sau khi các tổ chức xã hội dân sự kiện lên vì cho rằng kế hoạch thiếu tham vấn cộng đồng và tiềm ẩn rủi ro cho hệ thống y tế yếu kém của Kenya.
Mỹ cam kết chi 13,5 triệu USD cho nỗ lực phòng chống Ebola của Kenya và thêm 112 triệu USD cho ứng phó khu vực. Ngoại trưởng Marco Rubio nhấn mạnh Mỹ 'không thể và sẽ không cho phép bất kỳ ca Ebola nào vào lãnh thổ'. Cơ sở này dự kiến có 50 giường, với các khu cách ly và kiểm soát sinh học, cùng khoảng 30 nhân viên của Quân đoàn Y tế Công cộng Mỹ đã được triển khai tới Kenya.